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  • 怎样经由过程Forcite Plus盘算获得正确的径向散布函数图?
    1)起首确认盘算时系统巨细、力场参数、非键乞降要领等是不是公道; 2) 需对系统停止较长时间的动力学模仿,使系统充裕的均衡后,再停止相干效果剖析。 3)效果剖析时,拔取均衡后的系统轨迹停止响应的剖析;轨迹帧数要充足。 4)因为差别的原点距离和长度(不要凌驾总长度的一半),都邑发生差别量的统计样本,调解差别参数试一下。

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  • 运用Forcite Plus模块盘算扩散系数时需求注重哪些地方?供扩散系数时怎样考证此散布相符爱因斯坦散布?
    1)停止扩散系数盘算和获得时,需注重以下内容: a、 起首需对系统停止较长时间的动力学模仿,使系统充裕的均衡后,再停止相干效果剖析。 b、效果剖析时,拔取均衡后的系统轨迹停止响应的剖析,且轨迹帧数要充足。 c、因为差别的原点距离和长度,都邑发生差别量的统计样本,为了获得正确的扩散系数:以差别的初始构造停止反复屡次模仿,盘算获得均匀MSD。 d、去掉MSD曲线中的非散布地区(关于一个动力学轨迹,每每初始的,偶然以至是末端的,其实不相符直线干系,与模仿工夫中央局部的相符要求的数据完整是能够的)。 2)确认的要领为:做log(MSD)-log(t) 图,并停止线性拟合,考证斜率m是不是为1。斜率为1,示意为有用的散布,即爱因斯坦散布;当m<1时示意发作的是非常散布。然后做 msd-t="">

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  • 在Forcite plus模块对轨迹文件停止剖析时, Forcite Analysis对话框中的Concentration profile选项做出的图,其纵坐标的单元是什么?Relative concentration 该怎样明白?
    浓度Concentration是指单元体积内的原子数,在Forcite Analysis中停止Concentration profile剖析时,系统被分别为多个直方图bins,每一个直方图的浓度皆被思索。相对浓度Relative Concentration是指某一方向上直方图的浓度取全部系统浓度的比值,即原子的位置散布状况,是无量纲的。当且仅当所有原子质量雷同时等价于密度散布。

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  • 运用Forcite plus模块停止动力学盘算时,发生的.trj文件达1.6G,然则打不开。该怎样翻开呢?
    可实验将.trj文件转为.xtd文件再停止翻开,操作过程以下: 1)在MS Visualizer界面的盘算效果文件中,找到和轨迹文件相干的.xsd文件,将此文件经由过程File-Export输出为.msi的花样; 2)再将其经由过程File-Import导入到MS Visualizer操纵界面内; 3)取.msi统一文件夹中,经由过程File-Import引入.trj文件,可将其转换为.xtd情势。

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  • 在Forcite Plus模块中提交Dynamic盘算义务时,盘算失利且毛病提醒为:Dynamics calculation - Deviation in total energy (50063.4 kcal/mol) between successive steps was greater than the specified maximum (50000 kcal/mol),怎样调解参数制止报错?
    这个问题重要是盘算历程中能量偏向过大形成的,能够做以下调解:1) 构造充裕优化; 2)调解Time step数值巨细;3)修正控温、控压要领;4)低落温度。

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  • 声子盘算失利,效果文件PhonDisp.castep给出以下报错信息: *ERROR* in PHONON calculation: Prerequisite GEOMETRY OPTIMISATION has not been performed or is not converged to sufficient accuracy. Maximum force |F|max = 1.015 eV/ Å Parameter GEOM_FORCE_TOL = 0.5000E-0
    1)盘算失利重要是由于构造优化精度不足以到达盘算的要求;发起进步构造优化的收敛尺度,如构造优化more选项中能量的收敛尺度调解到10-8eV,SCF中SCF tolerance调解到10-9eV。 2)可实验提交义务前,经由过程Files-Save Files提早获得输入文件,然后在输入文件.param 中增加GEOM_FORCE_TOL : 0.07 ev/ang关键词,再以Run Files体式格局提交盘算义务。

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  • CASTEP盘算完能带构造后,怎样获得费米能级、价带顶和导带底的具体能量值?
    1)费米能级的获得-可在单点能盘算后获得的.castep文件中获得Fermi energy;大概盘算能带构造后,在盘算文件存储途径中的文件夹找到bandstr.band隐蔽文件,从中读取Fermi energy详细值,此时的单元为au。 2)价带顶和导带底的获得-可经由过程盘算能带构造后,在bandstr.castep文件(ms8.0今后的版本,查找bandstr.band隐蔽文件)中停止查找。起首经由过程CASTEP-Analysis-Band structure获得能带结构图bandstr.xcd,在图中肯定价带顶和导带低所处K点位置,然后在bandstr.castep文件中找到此K点坐标下对应的能量本征值;然后凭据系统中所露价电子数量,计算出价电子添补的轨道数量(价电子数量/2),根据此数量找到的数值即是价带顶的能量值,轨道数量+1即是导带底的能量值。

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